Madrasah Tsanawiyah Assholach didirikan pada 13 Juli 2003 oleh Yayasan Pondok Pesantren Assholach di bawah kepemimpinan Almukarrrom KH. Muzayyin Zain. Awalnya, madrasah ini berfungsi sebagai lembaga pendidikan non formal, fokus pada pembelajaran agama.
Dikembangkan karena keprihatinan pengasuh pondok terhadap kurangnya pendidikan formal bagi santri, madrasah ini mendapat dukungan tinggi dari masyarakat. Saat ini, Madrasah Tsanawiyah Assholach telah berkembang menjadi tujuh kelas putri dan lima kelas putra, dengan fasilitas pondok pesantren yang memungkinkan santri dari luar daerah untuk tinggal di asrama.